中国科学院上海生命科学研究院生物信息中心

  NimbleGen MS 200芯片扫描仪是首台针对NimbleGen DNA芯片进行优化，展示NimbleGen芯片所有潜能并且获取完整信息的高性能扫描仪。MS 200出色的2微米分辨率和更高的灵敏度无疑是从现有及未来NimbleGen更高密度芯片中获取高质量数据及可靠实验结果的最佳选择。您可以通过NimbleScan和SignalMap软件分析读取从MS 200获取的数据。
  MS 200的自动化特性能够满足高通量基因组学研究的需要，尤其适合于NimbleGen芯片平台。其48片自动进样器、整合的条形码读取器、自动聚焦、自动增益等高级性能，为研究人员提供简便易行的自动化研究工具，助您专注于科学研究。
  MS 200的高分辨率、高灵敏度以及高通量特性作为芯片实验的有机组成部分，能够充分释放NimbleGen高密度基因组学平台的全部潜能，在尖端科学实验中助您一臂之力。


图1：高通量、高分辨率及多达48张芯片的自动进样扫描特性使您快速获取高质量的可靠结果。

  产品优势
  ♦  高分辨率
    2微米像素分辨率使得高密度NimbleGen DNA芯片能够获得理想的扫描结果；
  ♦  自动化
    ·  自动进样装置可24小时批量处理多达48张芯片，而无需人工操作；
    ·  高级动态自动聚焦及自动增益特性确保扫描结果实时清晰明了；
    ·  内置QC内参芯片可对芯片结果进行轻松校正，保证扫描结果准确可靠；
    ·  整合的条形码读取器对样品进行简便的识别及追踪；
  ♦  高信噪比
    确保高质量数据及可靠的实验结果；
  ♦  活性炭空气过滤和独立的芯片夹
    能够保护荧光染料不被降解；
  ♦  可升级的开放平台
    确保了现有高密度及未来超高密度NimbleGen芯片的适配性。

NimbleGen 芯片扫描仪器性能
像素分辨率	2µm, 5µm, 10µm, 20µm, 40µm
动态范围	10⁵(16-bit数据格式)
推荐染料	Cyanine 3(Cy3), Cyanine 5(Cy5)
一致性	在22*60mm扫描区域里，CV非一致性小于4%
自动聚焦	自动增益功能确保最佳聚焦位置和角度，使扫描过程中点位始终处于数据聚焦状态
光源	两个固态激光器 (532nm和635nm)
芯片夹	最多可自动处理48张芯片，无需看管
自动增益调整	1－1000%，通道平衡
最大扫描区域	22*75mm
像素定位错误	每扫描7200个像素仅发生少于2个像素的位移
兼容玻片尺寸	25*75mm玻片(Agilent和NimbleGen玻片尺寸)
扫描速度	28分钟即可完成对2.1M芯片以2微米分辨率及启动自动增益功能进行双色同步扫描的数据获取；
臭氧保护	活性炭过滤气流

2µm Resolution	5µm Resolution

图2：NimbleGen 芯片进行扫描的图像结果。更高2µm分辨率能够从NimbleGen 高密度芯片中获取更高品质的实验数据及更可靠的实验结果。
	图3：信噪比性能数据与5µm分辨率扫描仪相比，MS 200扫描仪2µm分辨率能够提供约1.4倍更高的信噪比(数据源于NimbleGen CGH芯片)。提升的灵敏度以更低的背景噪音提供了更高质量的数据，保证了结果的可靠性。

图4： Burkitt淋巴瘤样本的CGH分析

使用NimbleGen Human CGH 3x720K Whole-Genome Tiling v3.0芯片，以正常基因组DNA为对照，对Burkitt淋巴瘤的染色体拷贝数变化进行分析。用2µm分辨率以及5µm分辨率扫描检测8号染色体上的大段缺失区域（从～8kb到～43Mb）和扩增区域（从～47Mb到～110Mb）。红色以及蓝色柱状图代表信噪比值，红色方柱大于6，蓝色方柱小于6。如图所示，2µm分辨率扫描结果能够提供更佳的信噪比（如更多的红色方柱所示），特别是在拷贝数扩增的区域。

产品名称	货号
MS 200 芯片扫描仪	05 394 341 001
MS 控制器	05 394 325 001
MS 200 软件	05 394 333 001
MS 200 操作手册	05 394 309 001

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